{"id":100302,"date":"2020-01-29T14:10:17","date_gmt":"2020-01-29T14:10:17","guid":{"rendered":"https:\/\/oncogen.ro\/?p=100302"},"modified":"2023-10-19T09:26:31","modified_gmt":"2023-10-19T09:26:31","slug":"cercetatorii-oncogen-propun-o-strategie-de-vaccinomica-personalizata-pentru-coronavirusul-din-china","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/cercetatorii-oncogen-propun-o-strategie-de-vaccinomica-personalizata-pentru-coronavirusul-din-china\/","title":{"rendered":"Cercet\u0103torii OncoGen propun o strategie de vaccinomic\u0103 personalizat\u0103 pentru coronavirusul din China"},"content":{"rendered":"

[et_pb_section fb_built=”1″ admin_label=”section” _builder_version=”4.16″ custom_padding=”0px||0px||true|false” global_colors_info=”{}” theme_builder_area=”post_content”][et_pb_row admin_label=”row” _builder_version=”4.16″ background_size=”initial” background_position=”top_left” background_repeat=”repeat” width=”100%” global_colors_info=”{}” theme_builder_area=”post_content”][et_pb_column type=”4_4″ _builder_version=”4.16″ custom_padding=”|||” global_colors_info=”{}” custom_padding__hover=”|||” theme_builder_area=”post_content”][et_pb_image src=”https:\/\/oncogen.oncoserv.ro\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/Picture-2.png” _builder_version=”4.22.1″ _module_preset=”default” theme_builder_area=”post_content” title_text=”Picture-2″ border_radii=”on|10px|10px|10px|10px” hover_enabled=”0″ sticky_enabled=”0″][\/et_pb_image][et_pb_text admin_label=”Text” _builder_version=”4.22.1″ text_font_size=”17px” text_line_height=”28px” background_size=”initial” background_position=”top_left” background_repeat=”repeat” global_colors_info=”{}” theme_builder_area=”post_content”]<\/p>\n

Virusul de pneumonie care provine din pia\u021ba de pe\u0219te din Wuhan, cunoscut ca \u0219i Noul Coronavirus 2019 (2019-nCoV) se aseam\u0103n\u0103 at\u00e2t cu viru\u0219ii cauzatori ai sindromului respirator acut sever (SARS) \u0219i sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS). Conform Nature Briefing, p\u00e2n\u0103 la 28 ianuarie, num\u0103rul de cazuri confirmate a dep\u0103\u0219it 4.500 bolnavi, dintre care mai mult 100 de persoane au decedat ca urmare a infec\u021biei. Prin compara\u021bie, SARS s-a r\u0103sp\u00e2ndit la nivel global \u00een 2002-03, infect\u00e2nd 8000 de persoane \u0219i ucig\u00e2nd peste 700 de oameni.<\/p>\n

Vaccinurile tradi\u021bionale pentru bolile virale au avut un succes limitat \u00een cazul epidemiilor virale cu o frecven\u021b\u0103 ridicat\u0103 de muta\u021bii.\u00a0 Abordarea pe care am folosit-o pentru identificarea poten\u021bialelor peptide candidate pentru vaccin urmeaz\u0103 o strategie mai personalizat\u0103, denumit\u0103 vaccinomic\u0103, care permite selec\u021bia de proteine virale-\u021bint\u0103 cu rat\u0103 de muta\u021bie mai sc\u0103zut\u0103 \u0219i construc\u021bia de peptide adaptate caracteristicilor genetice imune ale popula\u021biilor-\u021bint\u0103 ce pot varia \u00een func\u021bie de loca\u021bia geografic\u0103 \u0219i etnicitate.<\/p>\n

Pe baza varia\u021biei \u00een alela ce codeaz\u0103 MHC uman (antigen leucocitar uman), vaccinurile bazate pe peptide pot fi dezvoltate cu specificitate pentru o comunitate sau individ. Selec\u021bia peptidelor care pot ac\u021biona sub form\u0103 de vaccin este determinat\u0103 de capacitatea de legare a peptidei virale procesate cu moleculele majore de complex de histocompatibilitate (MHC) clasa I \u0219i II \u0219i poate varia \u00een func\u021bie de alelele HLA relevante. Propunerile noastre de peptide sunt aplicabile popula\u021biei rom\u00e2ne.<\/p>\n

Detalii tehnice ale strategiei de design pentru peptide:<\/strong><\/p>\n

Am selectat poten\u021biale peptide imunogenice care s\u0103 declan\u0219eze r\u0103spuns imun \u00eenn\u0103scut \u0219i dob\u00e2ndit (limfocite T CD4+ c\u00e2t \u0219i CD8+) \u00eempotriva nCov. \u00cen acest scop, am generat peptide sintetice lungi de 15-30 aminoacizi (SLPs), conform celor propuse de Rabu \u0219i col. (2019), folosind un linker sensibil la catepsin\u0103 (LLSVGG) pentru conectarea epitopilor restric\u021biona\u021bi la MHC clasa I la epitopi specifici pentru MHC clasa II, epitopul MHC clasa II fiind localizat \u00eentotdeauna la cap\u0103tul N-terminal al peptidului. Aceste peptide pot stimula simultan at\u00e2t limfocitele T CD8+ (citotoxice) c\u00e2t \u0219i limfocitele T CD4+ (helper) (\u00eempreun\u0103 cu sistemul imun \u00eenn\u0103scut).<\/p>\n

Tulpina de coronavirus Wuhan-Hu-1 folosit\u0103 pentru analiz\u0103 este identificat\u0103 ca MN908947.3 sau Ref Seq NC_045512<\/a>.<\/p>\n

Este un virus de tip ARN poli-adenilat monocatenar, cu sens pozitiv \u0219i un genom cu o dimensiune de \u00a029.9 kb (29903 bp), unul dintre cele mai mari dintre virusurile de tip ARN .<\/p>\n

Secven\u021be genomice complete p\u00e2n\u0103 \u00een prezent: proteine S \u0219i M importante ca \u021bint\u0103 pentru vaccinul anti-nCoV; S = spike (pentru aderen\u021b\u0103 \u0219i fuziune); M = membran\u0103 (pentru replicare \u0219i exocitoz\u0103 a virionului).<\/p>\n

Am folosit baza de date Immune Epitope Database (IEDB) pentru a identifica epitopii puternici pentru stimularea limfocitelor T din secven\u021bele proteinelor S \u0219i M. Pentru epitopii specifici celulelor T CD8 +, metoda de predic\u021bie a integrat capacitatea de legare a MHC clasa I, clivajul proteazomal al proteinei virale \u0219i eficien\u021ba transportului TAP. Au fost selecta\u021bi mai mul\u021bi epitopi pentru analize suplimentare, \u00een func\u021bie de scorul general ob\u021binut \u0219i dac\u0103 au prezentat o afinitate mare de legare la MHC (IC50 <50 nM). Pentru epitopii specifici limfocitelor T CD4+, s-a ales peptidul cu capacitatea cea mai mare de legare pentru MHC clasa II.<\/p>\n

Lista epitopilor T selecta\u021bi pe baza afinit\u0103\u021bii pentru cele mai frecvente alele HLA clasa I \u0219i II din popula\u021bia Rom\u00e2niei (luate ca exemplu pentru a demonstra principiul strategiei de vaccinomic\u0103 personalizat\u0103) pot fi g\u0103site \u00een publica\u021bia noastr\u0103\u00a0Preprints.<\/a><\/strong><\/p>\n

Peptidele imunogenice au fost dezvoltate prin aplicarea unei tehnologii folosite \u00een vaccinarea personalizat\u0103 \u00een cancer, bazat\u0103 pe \u201elong neoantigen peptides\u201d, utilizat\u0103 \u00een prezent \u00een studii clinice pentru tratarea cancerului.<\/p>\n

Acest model este un compromis \u00eentre strategia de vaccinare industrial\u0103 global\u0103 pe scar\u0103 larg\u0103 \u0219i cea personalizat\u0103 la nivel individual.<\/p>\n

Vom continua cu validarea acestor peptide \u0219i a modelului prezentat.<\/p>\n

Surs\u0103 imagine: Eye of Science\/SPL<\/p>\n

[\/et_pb_text][\/et_pb_column][\/et_pb_row][\/et_pb_section]<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Virusul de pneumonie care provine din pia\u021ba de pe\u0219te din Wuhan, cunoscut ca \u0219i Noul Coronavirus 2019 (2019-nCoV) se aseam\u0103n\u0103 at\u00e2t cu viru\u0219ii cauzatori ai sindromului respirator acut sever (SARS) \u0219i sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS). Conform Nature Briefing, p\u00e2n\u0103 la 28 ianuarie, num\u0103rul de cazuri confirmate a dep\u0103\u0219it 4.500 bolnavi, dintre care mai […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":100303,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_et_pb_use_builder":"on","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[21],"tags":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/100302"}],"collection":[{"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=100302"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/100302\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":100919,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/100302\/revisions\/100919"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/media\/100303"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=100302"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=100302"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/oncogen.ro\/ro\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=100302"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}