Departamentul de genomica

Scurtă prezentare:
În cadrul laboratorului de genomică investigăm variațiile genetice și epigenetice asociate cu susceptibilitatea de a dezvolta unele forme de cancer, în vederea utilizării informației dobândite pentru metode de diagnostic și prognostic mai performante. Laboratorul este dotat cu sisteme de automatizare și echipament versatil, cu un spectru larg de posibile aplicații științifice: extracția de material genetic și analiza unui panel cuprinzător de gene sub- sau supra-exprimate în cancer, identificarea de mutații punctiforme (SNPs) sau alte variații genetice prin secvențiere ADN, analiza statutului de metilare a unor gene prin metoda tratamentului cu bisulfit și secvențiere ADN. Prin colaborare cu laboratoarele de Microarray și de Culturi celulare din cadrul institutului OncoGen, genele asociate cu susceptibilitatea la cancer, identificate prin screening, sunt în continuare validate și confirmate prin teste in vitro, pe linii celulare tumorale umane.

Principalele activități/tehnici:

  • izolare de material genetic din diverse tipuri de culturi celulare, precum și din probe provenite de la pacienți (ADN, ARN, microARN, etc.)
  • analiza expresiei genice
  • analiza statutului de metilare a genelor
  • secvențiere ADN de ampliconi
  • genotipare de SNP

Personal:
Coordonator: Oana Gavriliuc, MS, PhD
Florina Bojin, MD, PhD
Ada Cean, Biotech Eng., PhD
Alexandra Ivan, Biotech Eng., PhD
Tehnicieni

Echipamente:

  • Extractor acizi nucleici MagMAX Express 96 (ThermoFisher)
  • Real-time PCR system (Roche Lightcycler 480 II)
  • Sistem de secvențiere Sanger sequencing system
  • Secvenializator Genetic Analyzer 3130XL (AB/Hitachi)

Comments are closed